Генетичне походження впливає на біологію та прогноз акральної меланоми
Згідно з дослідниками з Інституту Велкому Сангера при Національному автономному університеті Мексики (UNAM) та їх колегам, генетична схильність може відігравати ключову роль у розвитку та поведінці акральної меланоми, рідкісного та агресивного типу раку шкіри, що має важливе значення для діагностики та лікування.
Дослідницька група проаналізувала генетичний склад понад 100 пухлин акральної меланоми, виявлених у мексиканських пацієнтів, щоб зрозуміти, як розвивається цей вид раку, зокрема вивчити вплив походження на біологію пухлини. Вони виявили, що акральна меланома різниться, і три групи демонструють різні рівні експресії генів, які пов'язані з різними наслідками.
Опубліковане в журналі Nature дослідження є одним з найбільш повних на сьогоднішній день генетичних досліджень акральної меланоми в латиноамериканській популяції. Отримані результати підкреслюють важливість включення різних груп населення до дослідження раку та клінічні випробування для повного розуміння того, як розвиваються ракові захворювання та як вони реагують на лікування.
Чим відрізняється акральна меланома
Більшість меланом, різновиду раку шкіри, викликаються впливом ультрафіолетового (УФ) випромінювання сонця і зазвичай вивчаються у популяціях європейського походження.
Однак акральна меланома - це інший підтип раку шкіри, оскільки вона виникає на ділянках тіла, не схильних до впливу сонячного світла, зокрема, на долонях, підошвах ніг і під нігтями. У 2022 році в усьому світі було діагностовано понад 330 000 випадків меланоми, але акральна меланома вважається рідкісним типом, становлячи лише близько 1–3% усіх діагностованих випадків меланоми. Тим не менш, у багатьох випадках вона становить більшість діагностованих випадків у людей з корінним американським, азіатським та африканським походженням.
Незважаючи на відмінності, що спостерігаються при акральній меланомі, меланому часто розглядають як єдине захворювання, ґрунтуючись на знаннях, отриманих в ході досліджень меланоми, викликаної УФ-випромінюванням, хоча все більше даних свідчить про те, що акральна меланома поводиться інакше, ніж меланома,
В результаті акральна меланома історично була недостатньо вивчена, недостатньо представлена в дослідженнях геноміки раку та не має схваленого специфічного таргетного лікування. Ці прогалини особливо помітні в Латинській Америці, де національні онкологічні регістри обмежені чи відсутні.
Розробка дизайну дослідження за участю мексиканських пацієнтів
У новому дослідженні вчені прагнули зрозуміти, які генетичні зміни лежать в основі акральної меланоми в Латинській Америці, зосередивши увагу на пухлинах, які виявлені у мексиканських пацієнтів. Команда проаналізувала 123 пухлини від 92 мексиканських пацієнтів із діагнозом акральної меланоми, отримавши геномні дані в Інституті Сангера. Використовуючи комбінацію секвенування ДНК та аналізу експресії генів, дослідники вивчили мутації пухлин, великомасштабні генетичні зміни та закономірності активності генів.
Вони вивчили генетичне походження пацієнтів, що дозволило їм безпосередньо дослідити, як походження пов'язані з ДНК пухлини. Це дало дослідникам можливість пов'язати молекулярну структуру акральної меланоми з клінічними наслідками, забезпечивши глибоке розуміння того, як генетичний фон формує поведінку цього раку.
Генетичні відмінності, пов'язані з походженням
Дослідники виявили, що класичні мутації меланоми загалом зустрічалися набагато рідше в акральних меланомах у пацієнтів мексиканського походження. Наприклад, ген BRAF зазвичай містить інструкції для синтезу білка BRAF, який бере участь у процесах розвитку клітин. Мутована версія BRAF є приблизно в половині випадків меланом, викликаних УФ-випромінюванням. Однак у цій групі пацієнтів із більш європейським походженням ймовірність наявності мутацій BRAF була вищою, ніж у пацієнтів з індіанським походженням.
Аналізуючи активність генів у різних пухлинах, дослідники також виявили три окремих кластери акральної меланоми, які були пов'язані з різними наслідками. По-перше, пухлини, що демонструють більш високу експресію генів, пов'язаних з імунною системою, були пов'язані з найкращими наслідками. По-друге, пухлини, які демонстрували швидке зростання клітин та активні процеси пігментації - клітинні процеси, що регулюють вироблення пігменту в клітинах, - були пов'язані з рецидивами та гіршими наслідками. По-третє, група пухлин, що демонструють зміну метаболічного шляху, була пов'язана з більш варіабельними наслідками.
Спільно ці результати поглиблюють розуміння акральної меланоми. Це не єдине захворювання, а група пухлин із високим ступенем варіабельності, які чітко пов'язані з особливостями поведінки раку. Тому включення генетичної інформації про пухлини може поліпшити прогноз і сприяти розробці більш персоналізованого плану лікування.
Чому різноманітність у геноміці раку має значення
У більш широкому значенні дослідження підкреслює ключову проблему в дослідженнях раку: брак геномних даних з неєвропейських популяцій. Зосередившись на латиноамериканській популяції, дослідження демонструє, як дослідження, що включають різні групи населення, можуть призвести до більш точного та справедливого розуміння захворювання.
Лікар Патрісія Басурто-Лосада, перший автор дослідження з Національного автономного університету Мексики, сказала: «Ми виявили, що акральна меланома – це не єдине захворювання. Пухлини поділяються на різні біологічні групи, які пов'язані з різними наслідками для пацієнтів. Ця інформація може мати вирішальне значення для розробки таргетних методів лікування акральної меланоми в майбутньому і, зрештою, для покращення життя пацієнтів».
«У Латинській Америці існує проблема обмеженої кількості онкологічних регістрів, які необхідні для відстеження тенденцій захворюваності на рак з часом. Саме тому для нас вкрай важливо збирати та аналізувати дані, які допоможуть вченим, лікарям і, зрештою, пацієнтам забезпечити найкраще можливе лікування тим, у кого діагностована акральна меланома», - Доктор Патрісія Абрао Поссік, співавтор, міжнародний науковий співробітник Інституту Велкома Сангера та керівник групи.
Доктор Карла Даніела Роблес-Еспіноза, провідний автор дослідження та колишній міжнародний науковий співробітник Інституту Велкому Сангера при Національному автономному університеті Мексики, додала: «Коли пацієнти беруть участь у клінічних випробуваннях, немає універсального підходу. Щоб зрозуміти, наскільки ефективними є методи лікування, нам потрібні дослідження за участю людей з різним етнічним походженням. Це дослідження надає важливу інформацію про генетичний склад акральної меланоми, який може впливати на реакцію на лікування».
Доктор Девід Адамс, один із провідних авторів дослідження з Інституту Велкому Сангера, зазначив: «Наше дослідження наголошує на недостатньому представництві досліджень у галузі геноміки раку. Наголошуючи на необхідності більшого розмаїття у дослідженнях та клінічних випробуваннях, ми сподіваємося, що отримані результати сприятимуть покращенню результатів лікування пацієнтів з рідкісними та агресивними формами раку, такими як акральна меланома».
Джерело: Інститут Сангера при фонді Wellcome Trust