Барвники для маркування тканин використовуються для маркування та орієнтації зразків тканин для гістопатологічної обробки. Маркувати можна тільки видалені тканини. Пігменти барвників можуть створювати постійні плями на живих тканинах, тому барвник не можна наносити на живих пацієнтів.